敬一郎（柿原彻也 配音）是一个一无所有的孤独少年，刚刚失去双亲的他丧失了对生活的期望和热情，某日，敬一郎在垃圾堆里捡到了一个破旧遭人丢弃的机器人，感慨自己和它有着相同境遇的敬一郎将机器人带回了家，修缮完毕，取名为“小花”（浅野真澄 配音）。
　　小花的个性善良而又温柔，她的存在给敬一郎苍白枯燥的生活增添了一丝温暖。小花没有过去的记忆，心中唯一的愿望，就是希望能帮助敬一郎重新绽放笑容。一天，小花忽然晕倒了，敬一郎带着他四处求医，却被告知小花的机能已经到达了极限，于是，敬一郎带着小花来到了海边，这是小花一直都想要去的地方。

　　故事发生在二十一世纪初始，日本依旧笼罩在德川幕府的统治之下，柳生宗朗（平川大辅 配音）家中世代经营道场，宗朗本人则肩负着成为下任当家的沉重责任。尽管身为德川家康的臣子，但宗朗对幕府的独裁以及武应学园塾对于反抗学生的暴力镇压感到十分不满。他的不满招致了飞来横祸，不仅道场面临关门大吉的命运，宗朗更是遭到了学生会派出的精锐部队的追杀。
　　就在命悬一线之时，一位名为柳生十兵卫（悠木碧 配音）的红发少女突然从天而降击退了敌方，之后，柳生义仙（水原薰 配音）、真田幸村（钉宫理惠 配音）、后藤又兵卫（小林优 配音）等一干武江少女接二连三的出现在了宗朗的身边。